Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms