Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcho1Q8K285 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms