Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gtf3c1Q8K284 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gtf3c1Q8K284 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gtf3c1Q8K284 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gtf3c1Q8K284 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gtf3c1Q8K284 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gtf3c1Q8K284 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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Gtf3c1Q8K284 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gtf3c1Q8K284 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gtf3c1Q8K284 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gtf3c1Q8K284 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c1Q8K284 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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