Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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