Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms