Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClasrpQ8CFC7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms