Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc38Q8CDN8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc38Q8CDN8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc38Q8CDN8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc38Q8CDN8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc38Q8CDN8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms