Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lrif1Q8CDD9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lrif1Q8CDD9 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrif1Q8CDD9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrif1Q8CDD9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Lrif1Q8CDD9 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Lrif1Q8CDD9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms