Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Nhlrc3Q8CCH2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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