Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms