Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnot2Q8C5L3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnot2Q8C5L3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms