Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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FarsaQ8C0C7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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FarsaQ8C0C7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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FarsaQ8C0C7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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FarsaQ8C0C7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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FarsaQ8C0C7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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FarsaQ8C0C7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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FarsaQ8C0C7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
FarsaQ8C0C7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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