Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc30Q8BVF4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ccdc30Q8BVF4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ccdc30Q8BVF4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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