Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ssc5dQ8BV57 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ssc5dQ8BV57 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ssc5dQ8BV57 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ssc5dQ8BV57 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ssc5dQ8BV57 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ssc5dQ8BV57 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ssc5dQ8BV57 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ssc5dQ8BV57 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ssc5dQ8BV57 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ssc5dQ8BV57 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ssc5dQ8BV57 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ssc5dQ8BV57 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ssc5dQ8BV57 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssc5dQ8BV57 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms