Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg4bQ8BGE6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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