Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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H2-M10.4Q85ZW8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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H2-M10.4Q85ZW8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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