Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Lrfn4Q80XU8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Lrfn4Q80XU8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Lrfn4Q80XU8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Lrfn4Q80XU8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Lrfn4Q80XU8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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