Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Clec18aQ7TSQ1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms