Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Atxn7l1os1-201ENSMUST00000155877 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms