Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Shq1Q7TMX5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms