Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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