Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vstm2lQ6PDS0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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