Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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