Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trak1Q6PD31 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trak1Q6PD31 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms