Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Samd9lQ69Z37 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samd9lQ69Z37 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms