Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg9aQ68FE2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg9aQ68FE2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg9aQ68FE2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg9aQ68FE2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg9aQ68FE2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg9aQ68FE2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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