Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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