Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms