Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfbr2Q62312 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tgfbr2Q62312 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tgfbr2Q62312 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tgfbr2Q62312 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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