Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Sall3Q62255 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Sall3Q62255 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Sall3Q62255 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Sall3Q62255 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Sall3Q62255 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Sall3Q62255 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Sall3Q62255 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall3Q62255 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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