Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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Kdm5dQ62240 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Kdm5dQ62240 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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Kdm5dQ62240 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Kdm5dQ62240 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Kdm5dQ62240 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Kdm5dQ62240 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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