Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sema3cQ62181 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms