Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PtafrQ62035 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PtafrQ62035 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtafrQ62035 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PtafrQ62035 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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