Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms