Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3Q60803 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms