Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tsr1Q5SWD9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tsr1Q5SWD9 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tsr1Q5SWD9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tsr1Q5SWD9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tsr1Q5SWD9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tsr1Q5SWD9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tsr1Q5SWD9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tsr1Q5SWD9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tsr1Q5SWD9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tsr1Q5SWD9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tsr1Q5SWD9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms