Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sft2d1Q5SSN7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms