Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms