Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms