Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Trim58Q5NCC9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Trim58Q5NCC9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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