Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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CenpjQ569L8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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CenpjQ569L8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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CenpjQ569L8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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CenpjQ569L8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CenpjQ569L8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CenpjQ569L8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CenpjQ569L8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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CenpjQ569L8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CenpjQ569L8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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