Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Mbd3l2Q3UXB0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Mbd3l2Q3UXB0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms