Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm5460Q3UQ97 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm5460Q3UQ97 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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