Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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