Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Cops9Q3U898 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms