Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms