Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctdnep1Q3TP92 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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