Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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