Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Samd11Q1RNF8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Samd11Q1RNF8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms