Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd3Q14AI6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.5 ms